El Servicio de Patología Forense tiene como funciones la investigación médico-legal en todos los casos de muerte violenta o sospechosa de criminalidad, ordenada por la autoridad judicial, y la identificación de cadáveres y restos humanos. Es el servicio en el que se realizan las autopsias y está situado en la sede central del IMLCF. Estas funciones las realizan médicos forenses adscritos al Servicio, con la ayuda de los auxiliares de Autopsias.

El Servicio de Patología Forense se estructura en dos Secciones:

 La Sección de Prosectorado, a la que corresponde la identificación de restos óseos, cadáveres putrefactos o carbonizados y la apertura de cavidades. 

 La Sección de Histopatología, a la que corresponde la realización de todos los estudios microscópicos procedentes del prosectorado del Instituto.

El  Servicio de Clínica Médico Forense se ocupa del control periódico de los lesionados y la valoración de los daños corporales que sean objeto de actuaciones procesales, la asistencia a los detenidos que se encuentran a disposición judicial y la realización de los peritajes médico legales de distinta naturaleza. Estas funciones se realizan en las delegaciones situadas en edificios judiciales de los distintos partidos judiciales de la Provincia de Santa Cruz de Tenerife.

El Servicio de Patología Forense se estructura en dos Secciones:

 La Sección de Psiquiatría Forense, a la que corresponde la realización de los estudios psicológicos y psiquiátricos de especial complejidad.  

Dentro de esta sección se integra la Unidad de Valoración Forense Integral, ubicada en el palacio de justicia de San Cristóbal de La Laguna y conformada por médicos forenses, psicólogas/os forenses y trabajadora social, cuya función es realizar una valoración integrada y multidisciplinar en casos de violencia sobre la mujer, violencia en el ámbito familiar, violencia sexual (valoración de la compatibilidad, valoración de las secuelas psicológicas, valoración de la credibilidad), acoso o custodia de menores, así como la evaluación del cociente intelectual, la personalidad y el perfil psicológico de víctimas o sospechosos en procedimientos penales de distinta naturaleza y aquellas cuestiones en las que se solicite.

 La Sección de Policlínica a la que corresponde la valoración del daño corporal, seguimiento de lesionados/as, estudio de la violencia de tipo sexual, valoración de la capacidad para trabajar, etc.

El Servicio de Laboratorio Forense se encarga de la realización de análisis  biológicos, clínicos y toxicológicos de carácter preliminar, sin perjuicio de las competencias del Instituto Nacional de Toxicología y Ciencias Forenses, que en este sentido, actuará como centro de referencia en materias de su especialidad.

El servicio de Laboratorio Forense se estructura en tres secciones:

 La Sección de Análisis y Nuevas Tecnologías, a la que corresponde la realización de análisis biológicos y de toxicología preliminares y de urgencia, así como los estudios fotográficos, radiológicos y clínicos necesarios para la investigación médico forense, sin perjuicio de las funciones que el Reglamento Orgánico de los Médicos Forenses atribuye a los/las médicos forenses. 

 La Sección de Criminalística, a la que corresponde la realización de estudios y análisis preliminares de los indicios biológicos e inorgánicos, así como los estudios de identificación, antropología y odontología forense, sin perjuicio de las funciones que el Reglamento Orgánico de los Médicos Forenses atribuye a los/las médicos forenses.

 La Sección de Ordenación y Archivo, a la que corresponde la organización y supervisión del trabajo dentro de la sección, normalización de las tareas de almacenamiento, archivo y recuperación de los datos, documentos, muestras o cualquier otro tipo de información inherente a las pruebas periciales practicadas; sin perjuicio de las funciones que el Reglamento Orgánico de los Médicos Forenses atribuye a los/las médicos forenses.