La Orden por la que se regula la Prueba de acceso a las Enseñanzas Universitarias Oficiales de Grado, para el alumnado que haya cursado el Bachillerato, prevé la constitución de una comisión organizadora integrada por un representante o una representante de cada Universidad Pública Canaria, un o una representante del centro directivo competente en materia de Bachillerato, un o una representante del centro directivo competente en materia de universidades, dos representantes de la Inspección Educativa y dos representantes del profesorado de Bachillerato de centros públicos. La presidencia de la comisión organizadora será asumida alternativamente en cada curso por una de las personas representantes de las Universidades.
Compete a la Comisión Organizadora, entre otras funciones, el nombramiento de los integrantes y las integrantes de los tribunales y las subcomisiones de materias objeto de evaluación. En total, unos cuatrocientos profesores y profesoras universitarios y de Enseñanza Secundaria se hacen cargo de la organización, el desarrollo y la corrección de unas pruebas que evalúan a algo más de 10.000 alumnos y alumnas cada año. También recae en la Comisión Organizadora la resolución de las reclamaciones y cuantas incidencias relativas a la organización de las pruebas pudieran plantearse, estableciendo el procedimiento de reclamación de forma homogénea para ambas Universidades.