La estructura de gobernanza de la ECEA 2030 está formalizada bajo el modelo siguiente:

• Grupo directivo de la ECEA, que tendrá la responsabilidad de tomar las decisiones estratégicas.
• Equipo de gestión de la ECEA, enfocado a facilitar los procesos de ejecución y especialmente el seguimiento de las actuaciones.
• Grupo asesor de la ECEA, que se constituirá como un órgano consultivo de amplia participación social.
• Grupos técnicos de trabajo, que se constituirán por cada uno de los seis ejes de la ECEA.