El Banco de Datos de Cabo Verde se puso en marcha en 2003, con el propósito de disponer de una herramienta informática que facilitara la tarea de inventariar la diversidad biológica de este archipiélago. Fue creado por el Gobierno de Canarias, en el marco de la iniciativa comunitaria Interreg III B Açores, Madeira, Canarias, 2000-2006, con la que se pretende favorecer la cooperación transnacional para un desarrollo integrado entre los archipiélagos europeos macaronésicos y entre éstos y la República de Cabo Verde.

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